[PRNewswire] 스위프트바이오사이언시즈, 유니크 듀얼 인덱싱 키트 출시
-- 새로운 액셀-NGS 유니크 듀얼 인덱싱 키트, 리드 미할당 최소화함으로써 고품질의 결과물 확보
-- 멀티플렉스 차세대 시퀀싱 개선
(앤아버, 미시간주 2018년 4월 6일 PRNewswire=연합뉴스) 스위프트바이오사이언시즈(Swift Biosciences[https://swiftbiosci.com/ ])는 FFPE와 cfDNA 같은 샘플에서 체세포 돌연변이와 같이 발생 빈도가 낮은 변종 확인(variant calling)의 정확도를 개선하면서도 큰 스루풋의 강력한 고품질 멀티플렉스 시퀀싱을 구현하는 액셀-NGS(Accel-NGS(R)) 유니크 듀얼 인덱싱 키트[https://swiftbiosci.com/products/udis/ ]를 출시한다고 오늘 발표했다.
멀티플렉스 시퀀싱은 임상 연구, 약품 개발 및 임상 서비스 실험실에서 흔히 사용하는 차세대 시퀀싱(NGS) 기법이다. 액셀-NGS 유니크 듀얼 인덱싱 키트는 NGS 워크플로우에 반드시 사용되어야 하는데 왜냐하면 현재 사용 중인 툴들에는 인덱스 리드 에러, 멀티플렉스 이종 교배 캡처 워크플로우와 관련된 PCR-유발 키메라 현상, 그리고 패턴 플로우 셀의 인덱스 호핑 등으로 디멀티플렉싱의 문제가 발생하기 때문이다.
스위프트의 액셀-NGS 유니크 듀얼 인덱싱 키트는 i7 및 i5의 두 포지션을 위해 96개의 듀얼 인덱스로 구성된 세트로 개발되었으며 하기와 같이 다양한 애플리케이션에 사용할 수 있는 확장성과 신뢰성이 강화된 워크플로우를 구현한다.
- 발생 빈도가 낮은 체세포 변이 발견
- 포르말린-고정형 파라핀-임베디드 분석
- 인체 샘플 내 세균 검사
- 무세포 DNA 분석
스위프트의 글로벌 마케팅 담당 부사장 캔디아 브라운은 "당사는 리드 미할당에 직접 대처함으로써 종양 돌연변이 대상 프로파일링과 같이 새로운 애플리케이션을 개발할 수 있는 더 정확한 솔루션을 공급하고 있다"고 말했다.
액셀-NGS 유니크 듀얼 인덱싱 키트의 핵심 사양과 특장점은 다음과 같다.
- 모든 일루미나 시퀀싱 장치에 최적화
- 미할당 비율을 0.1% 이하로 개선
- 전체 제놈 시퀀싱, 전체 엑솜과 메틸화 분석 등 다양한 애플리케이션 가능
- 액셀-NGS 1S, 액셀-NGS 2S 및 액셀-NGS 메틸-시크 등 스위프트 라이브러리 조제 키트와 호환
스위프트의 제품 개발 담당 부사장 로리 쿠리하라는 "스위프트의 유니크한 듀얼 인덱스들은 시퀀싱 스루풋과 멀티플렉싱 기능이 지속해서 향상됨에 따라 발생 빈도가 낮은 변종 확인에 더 높은 신뢰도를 구현하며 데이터의 질을 유지할 수 있다"고 말했다.
이 새로운 인덱싱 키트는 모든 일루미나 플랫폼에 호환할 수 있도록 특별히 설계되었으며 현재 구매 가능하다[https://swiftbiosci.com/products/udis/#exp-product-specifications- ].
스위프트바이오사이언시즈
스위프트바이오사이언시즈는 NGS 라이브러리 조제 회사이다. 미시간주 앤아버에 있는 동사는 전체 제놈 시퀀싱, 목표 DNA 시퀀싱과 후성적 분석 등 차세대 시퀀싱에 기반을 둔 새로운 애플리케이션을 위한 최신 라이브러리 조제 솔루션을 개발하고 있다. 스위프트바이오사이언시즈 제품들은 주요 장치와 호환 가능하며 고객들이 어려운 생물 샘플 분석 작업을 더 빠르고, 쉬우며, 세밀하고, 정확하게 진행할 수 있도록 설계되었다. 스위프트바이오사이언시즈는 패시픽바이오사이언시즈(Pacific Biosciences(R)), 일루미나(Illumina(R))와 이온토렌트(Ion Torrent™) 등 세 개의 주요 시퀀싱 플랫폼에 모두 사용할 수 있는 라이브러리 조제 솔루션을 공급하는 최초의 회사이다.
동사는 2010년 2월에 설립되었으며 제품 개발을 통해 유전농업, 제약, 학계, 바이오테크 등의 다양한 업계와 종양 연구 분야에 새로운 애플리케이션을 구현하고 있다.
상세 정보가 필요할 경우 SwiftBioSci.com을 방문하거나 트위터(@SwiftBioSci)에서 스위프트바이오사이언시즈를 팔로우하기 바란다.
출처: 스위프트바이오사이언시즈(Swift Biosciences)
Swift Biosciences Launches Unique Dual Indexing Kits to Improve Multiplexed Next Generation Sequencing
-- New Accel-NGS Unique Dual Indexing Kits minimize read misassignments for higher quality results
ANN ARBOR, Michigan, April 6, 2018 /PRNewswire/ -- Swift Biosciences [https://swiftbiosci.com/ ] today announced the launch of its Accel-NGS(R) Unique Dual Indexing Kits [https://swiftbiosci.com/products/udis/ ], which deliver the power and value of high-throughput multiplexed sequencing while improving the accuracy of low frequency variant calling, such as somatic mutations, in samples such as FFPE and cfDNA.
Multiplexed sequencing is a commonly used technique among clinical research, drug development and clinical services labs utilizing next-generation sequencing (NGS). The Accel-NGS Unique Dual Indexing Kits are an essential addition to NGS workflows, as current tools can suffer from demultiplexing problems caused by index read errors, PCR-induced chimerism associated with multiplexed hybridization capture workflows, and index hopping on patterned flow cells.
Swift's Accel-NGS Unique Dual Indexing Kits, developed in a set of 96 dual indices for both i7 and i5 positions, provide a more scalable and reliable workflow for a range of applications including:
- Low-frequency somatic variant discovery
- Formalin-fixed paraffin-embedded analysis
- Microbial detection in human samples
- Cell-free DNA analysis
"By directly addressing read misassignments we are providing a more accurate solution which could open up new applications, such as tumor mutation burden profiling," said Candia Brown, Swift's Vice President of Global Marketing.
Key features and benefits of the Accel-NGS Unique Dual Indexing Kits include:
- Optimized across all Illumina sequencing instruments
- Improves misassignment rates to less than 0.1 percent
- Enables multiple applications including whole genome sequencing, whole exome and methylation analysis
- Compatibility with Swift library prep kits including Accel-NGS 1S, Accel-NGS 2S, and Accel-NGS Methyl-Seq
"Swift's unique dual indices provide higher confidence in calling low frequency variants and maintains data quality as sequencing throughput and multiplexing capability continue to increase," said Laurie Kurihara, PhD, Swift's Vice President of Product Development.
The new indexing kits are specifically designed and compatible for any Illumina platform and are now commercially available [https://swiftbiosci.com/products/udis/#exp-product-specifications- ].
About Swift Biosciences
Swift Biosciences is the NGS Library Prep company. Based in Ann Arbor, Michigan, the company develops novel library preparation solutions for emerging applications based on next-generation sequencing, including whole genome sequencing, targeted DNA sequencing, and epigenetic analysis. Swift Biosciences' products are designed to help customers analyze challenging biological samples faster, easier, and with greater sensitivity and accuracy, while being compatible with leading instrumentation. Swift Biosciences is the first company to offer library preparation solutions on all three major sequencing platforms, including Pacific Biosciences(R), Illumina(R) and Ion Torrent™.
The company opened its doors in February 2010, and its product development enables new applications in multiple industries, including agrigenomics, pharmaceutical, academic, biotechnology, and oncology research fields.
For more information, visit SwiftBioSci.com and follow Swift Biosciences on Twitter (@SwiftBioSci).
Source: Swift Biosciences
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